Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PompQ9CQT5 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PompQ9CQT5 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PompQ9CQT5 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PompQ9CQT5 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PompQ9CQT5 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PompQ9CQT5 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PompQ9CQT5 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PompQ9CQT5 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PompQ9CQT5 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PompQ9CQT5 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PompQ9CQT5 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PompQ9CQT5 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PompQ9CQT5 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PompQ9CQT5 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PompQ9CQT5 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PompQ9CQT5 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PompQ9CQT5 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PompQ9CQT5 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PompQ9CQT5 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PompQ9CQT5 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PompQ9CQT5 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PompQ9CQT5 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PompQ9CQT5 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PompQ9CQT5 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PompQ9CQT5 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PompQ9CQT5 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PompQ9CQT5 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PompQ9CQT5 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PompQ9CQT5 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PompQ9CQT5 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PompQ9CQT5 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PompQ9CQT5 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PompQ9CQT5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PompQ9CQT5 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PompQ9CQT5 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PompQ9CQT5 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PompQ9CQT5 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PompQ9CQT5 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PompQ9CQT5 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PompQ9CQT5 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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PompQ9CQT5 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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PompQ9CQT5 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PompQ9CQT5 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PompQ9CQT5 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PompQ9CQT5 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PompQ9CQT5 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PompQ9CQT5 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PompQ9CQT5 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PompQ9CQT5 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PompQ9CQT5 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PompQ9CQT5 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PompQ9CQT5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PompQ9CQT5 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PompQ9CQT5 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PompQ9CQT5 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PompQ9CQT5 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PompQ9CQT5 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PompQ9CQT5 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PompQ9CQT5 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PompQ9CQT5 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PompQ9CQT5 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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PompQ9CQT5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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PompQ9CQT5 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PompQ9CQT5 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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PompQ9CQT5 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PompQ9CQT5 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PompQ9CQT5 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PompQ9CQT5 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PompQ9CQT5 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PompQ9CQT5 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PompQ9CQT5 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PompQ9CQT5 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PompQ9CQT5 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PompQ9CQT5 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PompQ9CQT5 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PompQ9CQT5 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PompQ9CQT5 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PompQ9CQT5 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PompQ9CQT5 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PompQ9CQT5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PompQ9CQT5 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PompQ9CQT5 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PompQ9CQT5 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PompQ9CQT5 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PompQ9CQT5 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PompQ9CQT5 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PompQ9CQT5 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PompQ9CQT5 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PompQ9CQT5 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PompQ9CQT5 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PompQ9CQT5 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms