Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL6

Mrpl35, 39S ribosomal protein L35, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl35Q9CQL6 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Mrpl35Q9CQL6 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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