Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

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Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rdm1Q9CQK3 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rdm1Q9CQK3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Rdm1Q9CQK3 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms