Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC9

Sar1b, GTP-binding protein SAR1b, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1bQ9CQC9 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sar1bQ9CQC9 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sar1bQ9CQC9 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sar1bQ9CQC9 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sar1bQ9CQC9 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sar1bQ9CQC9 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sar1bQ9CQC9 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sar1bQ9CQC9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sar1bQ9CQC9 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sar1bQ9CQC9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sar1bQ9CQC9 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sar1bQ9CQC9 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sar1bQ9CQC9 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sar1bQ9CQC9 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sar1bQ9CQC9 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sar1bQ9CQC9 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sar1bQ9CQC9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sar1bQ9CQC9 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sar1bQ9CQC9 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sar1bQ9CQC9 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sar1bQ9CQC9 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sar1bQ9CQC9 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sar1bQ9CQC9 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sar1bQ9CQC9 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sar1bQ9CQC9 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sar1bQ9CQC9 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sar1bQ9CQC9 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sar1bQ9CQC9 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sar1bQ9CQC9 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sar1bQ9CQC9 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sar1bQ9CQC9 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sar1bQ9CQC9 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sar1bQ9CQC9 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sar1bQ9CQC9 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sar1bQ9CQC9 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sar1bQ9CQC9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sar1bQ9CQC9 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sar1bQ9CQC9 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sar1bQ9CQC9 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sar1bQ9CQC9 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sar1bQ9CQC9 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sar1bQ9CQC9 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sar1bQ9CQC9 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sar1bQ9CQC9 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sar1bQ9CQC9 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sar1bQ9CQC9 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sar1bQ9CQC9 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sar1bQ9CQC9 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sar1bQ9CQC9 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sar1bQ9CQC9 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sar1bQ9CQC9 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sar1bQ9CQC9 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sar1bQ9CQC9 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sar1bQ9CQC9 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sar1bQ9CQC9 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sar1bQ9CQC9 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sar1bQ9CQC9 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sar1bQ9CQC9 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sar1bQ9CQC9 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sar1bQ9CQC9 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sar1bQ9CQC9 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sar1bQ9CQC9 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sar1bQ9CQC9 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sar1bQ9CQC9 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sar1bQ9CQC9 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sar1bQ9CQC9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sar1bQ9CQC9 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sar1bQ9CQC9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sar1bQ9CQC9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sar1bQ9CQC9 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sar1bQ9CQC9 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sar1bQ9CQC9 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sar1bQ9CQC9 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sar1bQ9CQC9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sar1bQ9CQC9 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sar1bQ9CQC9 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sar1bQ9CQC9 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sar1bQ9CQC9 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sar1bQ9CQC9 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sar1bQ9CQC9 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sar1bQ9CQC9 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sar1bQ9CQC9 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sar1bQ9CQC9 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sar1bQ9CQC9 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sar1bQ9CQC9 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sar1bQ9CQC9 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sar1bQ9CQC9 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sar1bQ9CQC9 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sar1bQ9CQC9 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sar1bQ9CQC9 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sar1bQ9CQC9 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sar1bQ9CQC9 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sar1bQ9CQC9 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sar1bQ9CQC9 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sar1bQ9CQC9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sar1bQ9CQC9 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sar1bQ9CQC9 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sar1bQ9CQC9 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sar1bQ9CQC9 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sar1bQ9CQC9 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms