Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms