Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
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Chmp3Q9CQ10 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms