Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms