Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms