Protein–RNA interactions for Protein: Q99P81

Abcg3, ATP-binding cassette sub-family G member 3, mousemouse

Predictions only

Length 650 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg3Q99P81 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcg3Q99P81 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms