Protein–RNA interactions for Protein: Q99MX1

Usp26, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 26, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp26Q99MX1 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp26Q99MX1 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp26Q99MX1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp26Q99MX1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp26Q99MX1 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp26Q99MX1 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp26Q99MX1 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp26Q99MX1 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp26Q99MX1 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp26Q99MX1 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp26Q99MX1 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp26Q99MX1 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp26Q99MX1 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp26Q99MX1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp26Q99MX1 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp26Q99MX1 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp26Q99MX1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp26Q99MX1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp26Q99MX1 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp26Q99MX1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp26Q99MX1 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp26Q99MX1 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp26Q99MX1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp26Q99MX1 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp26Q99MX1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp26Q99MX1 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp26Q99MX1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp26Q99MX1 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp26Q99MX1 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp26Q99MX1 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp26Q99MX1 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp26Q99MX1 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp26Q99MX1 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp26Q99MX1 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp26Q99MX1 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp26Q99MX1 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp26Q99MX1 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp26Q99MX1 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp26Q99MX1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp26Q99MX1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp26Q99MX1 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp26Q99MX1 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp26Q99MX1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp26Q99MX1 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp26Q99MX1 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp26Q99MX1 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp26Q99MX1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp26Q99MX1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp26Q99MX1 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp26Q99MX1 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp26Q99MX1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp26Q99MX1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Usp26Q99MX1 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp26Q99MX1 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp26Q99MX1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp26Q99MX1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp26Q99MX1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp26Q99MX1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp26Q99MX1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp26Q99MX1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp26Q99MX1 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp26Q99MX1 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp26Q99MX1 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp26Q99MX1 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp26Q99MX1 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp26Q99MX1 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp26Q99MX1 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp26Q99MX1 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp26Q99MX1 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp26Q99MX1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp26Q99MX1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp26Q99MX1 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp26Q99MX1 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp26Q99MX1 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp26Q99MX1 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp26Q99MX1 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp26Q99MX1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp26Q99MX1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp26Q99MX1 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp26Q99MX1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp26Q99MX1 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp26Q99MX1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp26Q99MX1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp26Q99MX1 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp26Q99MX1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp26Q99MX1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp26Q99MX1 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp26Q99MX1 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp26Q99MX1 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp26Q99MX1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp26Q99MX1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp26Q99MX1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp26Q99MX1 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp26Q99MX1 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp26Q99MX1 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp26Q99MX1 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp26Q99MX1 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp26Q99MX1 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp26Q99MX1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp26Q99MX1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms