Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Tdrd1Q99MV1 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Tdrd1Q99MV1 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tdrd1Q99MV1 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Tdrd1Q99MV1 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Tdrd1Q99MV1 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tdrd1Q99MV1 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tdrd1Q99MV1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tdrd1Q99MV1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tdrd1Q99MV1 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tdrd1Q99MV1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tdrd1Q99MV1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tdrd1Q99MV1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tdrd1Q99MV1 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tdrd1Q99MV1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tdrd1Q99MV1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tdrd1Q99MV1 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tdrd1Q99MV1 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tdrd1Q99MV1 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tdrd1Q99MV1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tdrd1Q99MV1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tdrd1Q99MV1 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Tdrd1Q99MV1 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Tdrd1Q99MV1 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tdrd1Q99MV1 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tdrd1Q99MV1 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tdrd1Q99MV1 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tdrd1Q99MV1 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tdrd1Q99MV1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tdrd1Q99MV1 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tdrd1Q99MV1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Tdrd1Q99MV1 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Tdrd1Q99MV1 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tdrd1Q99MV1 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tdrd1Q99MV1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tdrd1Q99MV1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tdrd1Q99MV1 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Tdrd1Q99MV1 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tdrd1Q99MV1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tdrd1Q99MV1 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tdrd1Q99MV1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tdrd1Q99MV1 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tdrd1Q99MV1 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tdrd1Q99MV1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Tdrd1Q99MV1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tdrd1Q99MV1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tdrd1Q99MV1 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tdrd1Q99MV1 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Tdrd1Q99MV1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Tdrd1Q99MV1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tdrd1Q99MV1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Tdrd1Q99MV1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tdrd1Q99MV1 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tdrd1Q99MV1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tdrd1Q99MV1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tdrd1Q99MV1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tdrd1Q99MV1 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Tdrd1Q99MV1 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tdrd1Q99MV1 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tdrd1Q99MV1 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Tdrd1Q99MV1 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tdrd1Q99MV1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tdrd1Q99MV1 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Tdrd1Q99MV1 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tdrd1Q99MV1 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tdrd1Q99MV1 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tdrd1Q99MV1 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tdrd1Q99MV1 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tdrd1Q99MV1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tdrd1Q99MV1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tdrd1Q99MV1 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tdrd1Q99MV1 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tdrd1Q99MV1 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms