Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms