Protein–RNA interactions for Protein: Q99LM2

Cdk5rap3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap3Q99LM2 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms