Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms