Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE3

Lysmd3, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lysmd3Q99LE3 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms