Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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Ciao1Q99KN2 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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Ciao1Q99KN2 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
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Ciao1Q99KN2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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Ciao1Q99KN2 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms