Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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