Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Apobec3Q99J72 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
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