Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms