Protein–RNA interactions for Protein: Q924W5

Smc6, Structural maintenance of chromosomes protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc6Q924W5 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smc6Q924W5 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms