Protein–RNA interactions for Protein: Q923W1

Tgs1, Trimethylguanosine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgs1Q923W1 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms