Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms