Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms