Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR4

Nek8, Serine/threonine-protein kinase Nek8, mousemouse

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Length 698 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek8Q91ZR4 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek8Q91ZR4 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek8Q91ZR4 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek8Q91ZR4 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek8Q91ZR4 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek8Q91ZR4 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek8Q91ZR4 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek8Q91ZR4 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek8Q91ZR4 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek8Q91ZR4 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek8Q91ZR4 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek8Q91ZR4 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek8Q91ZR4 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek8Q91ZR4 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek8Q91ZR4 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek8Q91ZR4 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek8Q91ZR4 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek8Q91ZR4 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek8Q91ZR4 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek8Q91ZR4 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek8Q91ZR4 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek8Q91ZR4 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek8Q91ZR4 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek8Q91ZR4 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek8Q91ZR4 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek8Q91ZR4 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek8Q91ZR4 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek8Q91ZR4 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek8Q91ZR4 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek8Q91ZR4 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek8Q91ZR4 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek8Q91ZR4 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek8Q91ZR4 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek8Q91ZR4 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek8Q91ZR4 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek8Q91ZR4 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek8Q91ZR4 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek8Q91ZR4 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek8Q91ZR4 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek8Q91ZR4 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek8Q91ZR4 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek8Q91ZR4 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek8Q91ZR4 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek8Q91ZR4 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek8Q91ZR4 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek8Q91ZR4 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek8Q91ZR4 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek8Q91ZR4 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek8Q91ZR4 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek8Q91ZR4 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek8Q91ZR4 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek8Q91ZR4 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek8Q91ZR4 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek8Q91ZR4 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek8Q91ZR4 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Nek8Q91ZR4 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Nek8Q91ZR4 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nek8Q91ZR4 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nek8Q91ZR4 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nek8Q91ZR4 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nek8Q91ZR4 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nek8Q91ZR4 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nek8Q91ZR4 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nek8Q91ZR4 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nek8Q91ZR4 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nek8Q91ZR4 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nek8Q91ZR4 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nek8Q91ZR4 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nek8Q91ZR4 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nek8Q91ZR4 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Nek8Q91ZR4 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nek8Q91ZR4 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nek8Q91ZR4 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nek8Q91ZR4 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nek8Q91ZR4 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Nek8Q91ZR4 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nek8Q91ZR4 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nek8Q91ZR4 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nek8Q91ZR4 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Nek8Q91ZR4 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nek8Q91ZR4 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nek8Q91ZR4 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nek8Q91ZR4 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nek8Q91ZR4 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek8Q91ZR4 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek8Q91ZR4 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek8Q91ZR4 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek8Q91ZR4 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek8Q91ZR4 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek8Q91ZR4 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek8Q91ZR4 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek8Q91ZR4 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek8Q91ZR4 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek8Q91ZR4 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek8Q91ZR4 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms