Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms