Protein–RNA interactions for Protein: Q91YD4

Trpm2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm2Q91YD4 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms