Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD6

Vps36, Vacuolar protein-sorting-associated protein 36, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps36Q91XD6 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps36Q91XD6 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps36Q91XD6 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps36Q91XD6 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps36Q91XD6 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps36Q91XD6 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps36Q91XD6 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps36Q91XD6 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps36Q91XD6 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps36Q91XD6 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps36Q91XD6 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps36Q91XD6 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps36Q91XD6 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps36Q91XD6 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps36Q91XD6 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vps36Q91XD6 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vps36Q91XD6 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vps36Q91XD6 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vps36Q91XD6 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vps36Q91XD6 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vps36Q91XD6 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps36Q91XD6 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps36Q91XD6 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps36Q91XD6 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps36Q91XD6 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps36Q91XD6 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps36Q91XD6 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps36Q91XD6 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps36Q91XD6 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps36Q91XD6 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps36Q91XD6 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps36Q91XD6 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps36Q91XD6 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps36Q91XD6 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps36Q91XD6 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps36Q91XD6 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps36Q91XD6 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps36Q91XD6 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps36Q91XD6 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps36Q91XD6 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps36Q91XD6 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps36Q91XD6 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps36Q91XD6 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps36Q91XD6 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps36Q91XD6 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps36Q91XD6 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps36Q91XD6 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps36Q91XD6 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps36Q91XD6 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps36Q91XD6 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps36Q91XD6 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps36Q91XD6 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps36Q91XD6 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps36Q91XD6 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps36Q91XD6 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps36Q91XD6 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps36Q91XD6 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps36Q91XD6 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps36Q91XD6 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps36Q91XD6 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps36Q91XD6 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps36Q91XD6 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps36Q91XD6 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps36Q91XD6 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps36Q91XD6 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps36Q91XD6 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps36Q91XD6 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps36Q91XD6 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps36Q91XD6 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps36Q91XD6 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps36Q91XD6 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps36Q91XD6 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps36Q91XD6 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps36Q91XD6 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps36Q91XD6 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps36Q91XD6 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps36Q91XD6 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps36Q91XD6 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps36Q91XD6 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps36Q91XD6 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps36Q91XD6 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps36Q91XD6 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps36Q91XD6 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps36Q91XD6 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps36Q91XD6 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps36Q91XD6 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps36Q91XD6 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps36Q91XD6 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps36Q91XD6 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps36Q91XD6 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps36Q91XD6 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps36Q91XD6 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps36Q91XD6 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps36Q91XD6 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps36Q91XD6 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps36Q91XD6 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps36Q91XD6 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps36Q91XD6 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps36Q91XD6 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps36Q91XD6 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms