Protein–RNA interactions for Protein: Q91W86

Vps11, Vacuolar protein sorting-associated protein 11 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps11Q91W86 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps11Q91W86 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps11Q91W86 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps11Q91W86 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps11Q91W86 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps11Q91W86 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps11Q91W86 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps11Q91W86 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps11Q91W86 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps11Q91W86 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps11Q91W86 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Vps11Q91W86 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps11Q91W86 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps11Q91W86 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps11Q91W86 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps11Q91W86 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps11Q91W86 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps11Q91W86 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps11Q91W86 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps11Q91W86 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps11Q91W86 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps11Q91W86 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps11Q91W86 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps11Q91W86 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps11Q91W86 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps11Q91W86 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vps11Q91W86 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vps11Q91W86 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vps11Q91W86 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vps11Q91W86 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vps11Q91W86 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vps11Q91W86 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vps11Q91W86 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vps11Q91W86 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vps11Q91W86 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vps11Q91W86 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vps11Q91W86 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vps11Q91W86 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Vps11Q91W86 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vps11Q91W86 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vps11Q91W86 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vps11Q91W86 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vps11Q91W86 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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