Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Smg8Q8VE18 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smg8Q8VE18 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smg8Q8VE18 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smg8Q8VE18 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smg8Q8VE18 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smg8Q8VE18 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Smg8Q8VE18 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smg8Q8VE18 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smg8Q8VE18 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smg8Q8VE18 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smg8Q8VE18 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smg8Q8VE18 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smg8Q8VE18 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Smg8Q8VE18 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smg8Q8VE18 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smg8Q8VE18 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smg8Q8VE18 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Smg8Q8VE18 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smg8Q8VE18 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smg8Q8VE18 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Smg8Q8VE18 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Smg8Q8VE18 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Smg8Q8VE18 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Smg8Q8VE18 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smg8Q8VE18 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smg8Q8VE18 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Smg8Q8VE18 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Smg8Q8VE18 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Smg8Q8VE18 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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