Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDC1

Fyco1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fyco1Q8VDC1 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms