Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Slc6a20aQ8VDB9 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Slc6a20aQ8VDB9 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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