Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms