Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4J6

Mkl1, MKL/myocardin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 964 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkl1Q8K4J6 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Mkl1Q8K4J6 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mkl1Q8K4J6 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mkl1Q8K4J6 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mkl1Q8K4J6 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mkl1Q8K4J6 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Mkl1Q8K4J6 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mkl1Q8K4J6 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mkl1Q8K4J6 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mkl1Q8K4J6 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mkl1Q8K4J6 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mkl1Q8K4J6 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mkl1Q8K4J6 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mkl1Q8K4J6 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mkl1Q8K4J6 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mkl1Q8K4J6 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mkl1Q8K4J6 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mkl1Q8K4J6 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mkl1Q8K4J6 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mkl1Q8K4J6 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mkl1Q8K4J6 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mkl1Q8K4J6 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mkl1Q8K4J6 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mkl1Q8K4J6 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mkl1Q8K4J6 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mkl1Q8K4J6 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mkl1Q8K4J6 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mkl1Q8K4J6 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mkl1Q8K4J6 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mkl1Q8K4J6 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mkl1Q8K4J6 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mkl1Q8K4J6 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mkl1Q8K4J6 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mkl1Q8K4J6 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mkl1Q8K4J6 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mkl1Q8K4J6 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mkl1Q8K4J6 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mkl1Q8K4J6 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mkl1Q8K4J6 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mkl1Q8K4J6 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mkl1Q8K4J6 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mkl1Q8K4J6 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Mkl1Q8K4J6 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mkl1Q8K4J6 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mkl1Q8K4J6 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mkl1Q8K4J6 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mkl1Q8K4J6 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mkl1Q8K4J6 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mkl1Q8K4J6 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mkl1Q8K4J6 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mkl1Q8K4J6 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mkl1Q8K4J6 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mkl1Q8K4J6 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mkl1Q8K4J6 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mkl1Q8K4J6 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mkl1Q8K4J6 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mkl1Q8K4J6 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mkl1Q8K4J6 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mkl1Q8K4J6 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mkl1Q8K4J6 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
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Mkl1Q8K4J6 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mkl1Q8K4J6 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mkl1Q8K4J6 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Mkl1Q8K4J6 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Mkl1Q8K4J6 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mkl1Q8K4J6 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mkl1Q8K4J6 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mkl1Q8K4J6 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mkl1Q8K4J6 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mkl1Q8K4J6 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mkl1Q8K4J6 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mkl1Q8K4J6 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mkl1Q8K4J6 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mkl1Q8K4J6 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Mkl1Q8K4J6 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mkl1Q8K4J6 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mkl1Q8K4J6 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mkl1Q8K4J6 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mkl1Q8K4J6 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mkl1Q8K4J6 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mkl1Q8K4J6 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mkl1Q8K4J6 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Mkl1Q8K4J6 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mkl1Q8K4J6 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mkl1Q8K4J6 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mkl1Q8K4J6 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mkl1Q8K4J6 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mkl1Q8K4J6 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mkl1Q8K4J6 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mkl1Q8K4J6 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mkl1Q8K4J6 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms