Protein–RNA interactions for Protein: Q8K389

Cdk5rap2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap2Q8K389 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdk5rap2Q8K389 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdk5rap2Q8K389 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdk5rap2Q8K389 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdk5rap2Q8K389 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdk5rap2Q8K389 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdk5rap2Q8K389 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdk5rap2Q8K389 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdk5rap2Q8K389 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdk5rap2Q8K389 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdk5rap2Q8K389 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdk5rap2Q8K389 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdk5rap2Q8K389 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdk5rap2Q8K389 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdk5rap2Q8K389 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdk5rap2Q8K389 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdk5rap2Q8K389 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdk5rap2Q8K389 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdk5rap2Q8K389 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdk5rap2Q8K389 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdk5rap2Q8K389 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdk5rap2Q8K389 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdk5rap2Q8K389 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdk5rap2Q8K389 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdk5rap2Q8K389 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdk5rap2Q8K389 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdk5rap2Q8K389 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdk5rap2Q8K389 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdk5rap2Q8K389 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdk5rap2Q8K389 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdk5rap2Q8K389 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdk5rap2Q8K389 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdk5rap2Q8K389 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdk5rap2Q8K389 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdk5rap2Q8K389 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdk5rap2Q8K389 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdk5rap2Q8K389 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdk5rap2Q8K389 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdk5rap2Q8K389 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdk5rap2Q8K389 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdk5rap2Q8K389 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdk5rap2Q8K389 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdk5rap2Q8K389 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdk5rap2Q8K389 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdk5rap2Q8K389 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdk5rap2Q8K389 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdk5rap2Q8K389 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdk5rap2Q8K389 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdk5rap2Q8K389 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdk5rap2Q8K389 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdk5rap2Q8K389 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdk5rap2Q8K389 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdk5rap2Q8K389 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdk5rap2Q8K389 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdk5rap2Q8K389 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdk5rap2Q8K389 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdk5rap2Q8K389 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdk5rap2Q8K389 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdk5rap2Q8K389 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdk5rap2Q8K389 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdk5rap2Q8K389 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdk5rap2Q8K389 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdk5rap2Q8K389 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdk5rap2Q8K389 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdk5rap2Q8K389 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdk5rap2Q8K389 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdk5rap2Q8K389 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdk5rap2Q8K389 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdk5rap2Q8K389 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdk5rap2Q8K389 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdk5rap2Q8K389 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdk5rap2Q8K389 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdk5rap2Q8K389 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdk5rap2Q8K389 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdk5rap2Q8K389 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdk5rap2Q8K389 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdk5rap2Q8K389 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdk5rap2Q8K389 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdk5rap2Q8K389 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdk5rap2Q8K389 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdk5rap2Q8K389 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdk5rap2Q8K389 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdk5rap2Q8K389 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdk5rap2Q8K389 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdk5rap2Q8K389 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdk5rap2Q8K389 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdk5rap2Q8K389 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdk5rap2Q8K389 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdk5rap2Q8K389 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdk5rap2Q8K389 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdk5rap2Q8K389 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdk5rap2Q8K389 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdk5rap2Q8K389 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdk5rap2Q8K389 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms