Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms