Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2I9

Fbxo18, F-box DNA helicase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo18Q8K2I9 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms