Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2H2

Otud6b, OTU domain-containing protein 6B, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6bQ8K2H2 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms