Protein–RNA interactions for Protein: Q8K299

Scara5, Scavenger receptor class A member 5, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scara5Q8K299 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scara5Q8K299 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scara5Q8K299 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scara5Q8K299 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Scara5Q8K299 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scara5Q8K299 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scara5Q8K299 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Scara5Q8K299 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scara5Q8K299 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Scara5Q8K299 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Scara5Q8K299 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Scara5Q8K299 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scara5Q8K299 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Scara5Q8K299 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scara5Q8K299 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Scara5Q8K299 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scara5Q8K299 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Scara5Q8K299 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scara5Q8K299 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scara5Q8K299 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scara5Q8K299 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Scara5Q8K299 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scara5Q8K299 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Scara5Q8K299 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Scara5Q8K299 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scara5Q8K299 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Scara5Q8K299 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Scara5Q8K299 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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