Protein–RNA interactions for Protein: Q8K285

Fcho1, F-BAR domain only protein 1, mousemouse

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho1Q8K285 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Fcho1Q8K285 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fcho1Q8K285 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms