Protein–RNA interactions for Protein: Q8K212

Pacs1, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, mousemouse

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Length 961 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs1Q8K212 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pacs1Q8K212 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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