Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Cldn34c1Q8K193 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Cldn34c1Q8K193 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Cldn34c1Q8K193 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Cldn34c1Q8K193 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Cldn34c1Q8K193 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Cldn34c1Q8K193 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Cldn34c1Q8K193 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Cldn34c1Q8K193 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Cldn34c1Q8K193 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Cldn34c1Q8K193 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Cldn34c1Q8K193 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Cldn34c1Q8K193 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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