Protein–RNA interactions for Protein: Q8HWB2

H2-Q4, Histocompatibility 2, Q region locus 4, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q4Q8HWB2 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-Q4Q8HWB2 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-Q4Q8HWB2 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-Q4Q8HWB2 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-Q4Q8HWB2 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-Q4Q8HWB2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-Q4Q8HWB2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-Q4Q8HWB2 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-Q4Q8HWB2 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-Q4Q8HWB2 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-Q4Q8HWB2 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-Q4Q8HWB2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-Q4Q8HWB2 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
H2-Q4Q8HWB2 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
H2-Q4Q8HWB2 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-Q4Q8HWB2 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-Q4Q8HWB2 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-Q4Q8HWB2 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-Q4Q8HWB2 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-Q4Q8HWB2 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-Q4Q8HWB2 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-Q4Q8HWB2 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-Q4Q8HWB2 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-Q4Q8HWB2 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-Q4Q8HWB2 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-Q4Q8HWB2 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-Q4Q8HWB2 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-Q4Q8HWB2 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-Q4Q8HWB2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-Q4Q8HWB2 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-Q4Q8HWB2 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-Q4Q8HWB2 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-Q4Q8HWB2 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-Q4Q8HWB2 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-Q4Q8HWB2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-Q4Q8HWB2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-Q4Q8HWB2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-Q4Q8HWB2 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-Q4Q8HWB2 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-Q4Q8HWB2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-Q4Q8HWB2 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-Q4Q8HWB2 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-Q4Q8HWB2 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-Q4Q8HWB2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-Q4Q8HWB2 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-Q4Q8HWB2 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-Q4Q8HWB2 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-Q4Q8HWB2 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-Q4Q8HWB2 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-Q4Q8HWB2 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-Q4Q8HWB2 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-Q4Q8HWB2 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-Q4Q8HWB2 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-Q4Q8HWB2 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-Q4Q8HWB2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-Q4Q8HWB2 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-Q4Q8HWB2 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-Q4Q8HWB2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-Q4Q8HWB2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-Q4Q8HWB2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-Q4Q8HWB2 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-Q4Q8HWB2 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-Q4Q8HWB2 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-Q4Q8HWB2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-Q4Q8HWB2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-Q4Q8HWB2 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-Q4Q8HWB2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Q4Q8HWB2 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Q4Q8HWB2 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Q4Q8HWB2 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Q4Q8HWB2 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Q4Q8HWB2 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Q4Q8HWB2 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Q4Q8HWB2 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Q4Q8HWB2 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Q4Q8HWB2 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Q4Q8HWB2 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Q4Q8HWB2 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Q4Q8HWB2 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Q4Q8HWB2 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Q4Q8HWB2 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Q4Q8HWB2 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Q4Q8HWB2 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Q4Q8HWB2 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Q4Q8HWB2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Q4Q8HWB2 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Q4Q8HWB2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-Q4Q8HWB2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-Q4Q8HWB2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-Q4Q8HWB2 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-Q4Q8HWB2 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-Q4Q8HWB2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-Q4Q8HWB2 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-Q4Q8HWB2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-Q4Q8HWB2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-Q4Q8HWB2 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-Q4Q8HWB2 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-Q4Q8HWB2 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-Q4Q8HWB2 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-Q4Q8HWB2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms