Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI04

Cog3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog3Q8CI04 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cog3Q8CI04 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cog3Q8CI04 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cog3Q8CI04 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cog3Q8CI04 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cog3Q8CI04 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cog3Q8CI04 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cog3Q8CI04 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Cog3Q8CI04 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cog3Q8CI04 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cog3Q8CI04 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cog3Q8CI04 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cog3Q8CI04 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cog3Q8CI04 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cog3Q8CI04 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cog3Q8CI04 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cog3Q8CI04 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cog3Q8CI04 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cog3Q8CI04 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cog3Q8CI04 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cog3Q8CI04 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cog3Q8CI04 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cog3Q8CI04 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cog3Q8CI04 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cog3Q8CI04 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cog3Q8CI04 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cog3Q8CI04 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cog3Q8CI04 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cog3Q8CI04 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cog3Q8CI04 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cog3Q8CI04 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cog3Q8CI04 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cog3Q8CI04 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cog3Q8CI04 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cog3Q8CI04 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cog3Q8CI04 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cog3Q8CI04 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cog3Q8CI04 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cog3Q8CI04 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cog3Q8CI04 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cog3Q8CI04 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cog3Q8CI04 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cog3Q8CI04 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cog3Q8CI04 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cog3Q8CI04 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cog3Q8CI04 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cog3Q8CI04 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cog3Q8CI04 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cog3Q8CI04 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cog3Q8CI04 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cog3Q8CI04 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cog3Q8CI04 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cog3Q8CI04 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cog3Q8CI04 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cog3Q8CI04 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cog3Q8CI04 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cog3Q8CI04 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cog3Q8CI04 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cog3Q8CI04 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cog3Q8CI04 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cog3Q8CI04 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cog3Q8CI04 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cog3Q8CI04 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cog3Q8CI04 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cog3Q8CI04 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cog3Q8CI04 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cog3Q8CI04 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cog3Q8CI04 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cog3Q8CI04 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cog3Q8CI04 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cog3Q8CI04 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cog3Q8CI04 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cog3Q8CI04 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cog3Q8CI04 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cog3Q8CI04 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cog3Q8CI04 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cog3Q8CI04 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cog3Q8CI04 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cog3Q8CI04 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cog3Q8CI04 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cog3Q8CI04 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cog3Q8CI04 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cog3Q8CI04 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cog3Q8CI04 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cog3Q8CI04 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cog3Q8CI04 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cog3Q8CI04 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms