Protein–RNA interactions for Protein: Q8CG50

Rab43, Ras-related protein Rab-43, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab43Q8CG50 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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