Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEF8

Rnf222, RING finger protein 222, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf222Q8CEF8 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf222Q8CEF8 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf222Q8CEF8 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf222Q8CEF8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf222Q8CEF8 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf222Q8CEF8 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf222Q8CEF8 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms