Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE50

Snx30, Sorting nexin-30, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx30Q8CE50 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms