Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms