Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc178Q8CDV0 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc178Q8CDV0 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc178Q8CDV0 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc178Q8CDV0 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc178Q8CDV0 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc178Q8CDV0 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc178Q8CDV0 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc178Q8CDV0 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc178Q8CDV0 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc178Q8CDV0 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc178Q8CDV0 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc178Q8CDV0 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc178Q8CDV0 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc178Q8CDV0 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc178Q8CDV0 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc178Q8CDV0 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc178Q8CDV0 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc178Q8CDV0 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc178Q8CDV0 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc178Q8CDV0 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc178Q8CDV0 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc178Q8CDV0 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc178Q8CDV0 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc178Q8CDV0 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc178Q8CDV0 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc178Q8CDV0 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc178Q8CDV0 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc178Q8CDV0 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc178Q8CDV0 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc178Q8CDV0 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc178Q8CDV0 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc178Q8CDV0 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc178Q8CDV0 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc178Q8CDV0 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc178Q8CDV0 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc178Q8CDV0 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc178Q8CDV0 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc178Q8CDV0 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc178Q8CDV0 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc178Q8CDV0 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc178Q8CDV0 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc178Q8CDV0 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc178Q8CDV0 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc178Q8CDV0 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc178Q8CDV0 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc178Q8CDV0 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc178Q8CDV0 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc178Q8CDV0 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc178Q8CDV0 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc178Q8CDV0 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc178Q8CDV0 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc178Q8CDV0 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc178Q8CDV0 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc178Q8CDV0 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc178Q8CDV0 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc178Q8CDV0 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc178Q8CDV0 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc178Q8CDV0 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc178Q8CDV0 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc178Q8CDV0 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc178Q8CDV0 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc178Q8CDV0 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc178Q8CDV0 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc178Q8CDV0 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc178Q8CDV0 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc178Q8CDV0 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc178Q8CDV0 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc178Q8CDV0 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc178Q8CDV0 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc178Q8CDV0 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc178Q8CDV0 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc178Q8CDV0 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc178Q8CDV0 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc178Q8CDV0 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc178Q8CDV0 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc178Q8CDV0 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc178Q8CDV0 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc178Q8CDV0 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc178Q8CDV0 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc178Q8CDV0 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc178Q8CDV0 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc178Q8CDV0 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc178Q8CDV0 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc178Q8CDV0 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc178Q8CDV0 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc178Q8CDV0 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc178Q8CDV0 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc178Q8CDV0 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc178Q8CDV0 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc178Q8CDV0 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc178Q8CDV0 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc178Q8CDV0 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc178Q8CDV0 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc178Q8CDV0 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc178Q8CDV0 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc178Q8CDV0 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc178Q8CDV0 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc178Q8CDV0 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc178Q8CDV0 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms