Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Lrif1Q8CDD9 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrif1Q8CDD9 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrif1Q8CDD9 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Lrif1Q8CDD9 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Lrif1Q8CDD9 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrif1Q8CDD9 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Lrif1Q8CDD9 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Lrif1Q8CDD9 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Lrif1Q8CDD9 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Lrif1Q8CDD9 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Lrif1Q8CDD9 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Lrif1Q8CDD9 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Lrif1Q8CDD9 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrif1Q8CDD9 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrif1Q8CDD9 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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