Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCN5

Bcas3, Breast carcinoma-amplified sequence 3 homolog, mousemouse

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Length 928 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcas3Q8CCN5 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Bcas3Q8CCN5 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Bcas3Q8CCN5 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Bcas3Q8CCN5 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Bcas3Q8CCN5 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Bcas3Q8CCN5 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Bcas3Q8CCN5 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Bcas3Q8CCN5 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Bcas3Q8CCN5 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Bcas3Q8CCN5 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Bcas3Q8CCN5 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Bcas3Q8CCN5 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bcas3Q8CCN5 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Bcas3Q8CCN5 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bcas3Q8CCN5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bcas3Q8CCN5 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bcas3Q8CCN5 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bcas3Q8CCN5 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bcas3Q8CCN5 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bcas3Q8CCN5 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bcas3Q8CCN5 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bcas3Q8CCN5 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bcas3Q8CCN5 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Bcas3Q8CCN5 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bcas3Q8CCN5 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bcas3Q8CCN5 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bcas3Q8CCN5 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Bcas3Q8CCN5 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Bcas3Q8CCN5 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bcas3Q8CCN5 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bcas3Q8CCN5 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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